30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2473 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  577  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  74.74 
 
 		 278 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  74.65 
 
 		 281 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  73.59 
 
 		 281 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  78.93 
 
 		 285 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  55.78 
 
 		 280 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  51.35 
 
 		 280 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  46.38 
 
 		 260 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  47.47 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  48.96 
 
 		 268 aa  221  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  49.57 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  47.54 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  47.1 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  40.25 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  41.74 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  41.2 
 
 		 242 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  40.93 
 
 		 238 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  34.02 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  33.5 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  36.1 
 
 		 218 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  34.42 
 
 		 235 aa  85.9  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  32.02 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  29.27 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  29.63 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.1 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  34.13 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  28.9 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  28.9 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  27.78 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3936  hypothetical protein  27.7 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>