30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2523 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  537  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  52.86 
 
 
252 aa  208  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  45.29 
 
 
280 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  42.61 
 
 
278 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  43.32 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  45.97 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  42.15 
 
 
281 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  45.71 
 
 
268 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  39.68 
 
 
284 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  44.19 
 
 
258 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  44.65 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  41.71 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  41.71 
 
 
260 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  41.78 
 
 
280 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  42.23 
 
 
260 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  43.07 
 
 
242 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  39.64 
 
 
270 aa  128  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  36.74 
 
 
235 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  41.67 
 
 
238 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  36.49 
 
 
245 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  33.18 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  32.7 
 
 
251 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  36.27 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  32.7 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  32.54 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  32.7 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.85 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  32.67 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  31.55 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3936  hypothetical protein  31.13 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.144053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>