30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0766 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  100 
 
 		 245 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  52.36 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  37.28 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  37.12 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  36.49 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  32.3 
 
 		 281 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  35.89 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  33.18 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  35.98 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  34.3 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.41 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  33.5 
 
 		 284 aa  95.1  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  34.47 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  33.5 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  33.9 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  33.66 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  34.17 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  33.74 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  31.76 
 
 		 268 aa  89  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  35.58 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  31.88 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  33.91 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  31.02 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  33.65 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  33.81 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  34.38 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  33.46 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  33.85 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3936  hypothetical protein  31.92 
 
 		 264 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>