30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1397 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  100 
 
 		 278 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  81.49 
 
 		 281 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  82.21 
 
 		 281 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  73.94 
 
 		 284 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  78.95 
 
 		 285 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  55.26 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  51.88 
 
 		 280 aa  248  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  45.93 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  48.07 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  48.61 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  48.02 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  47.6 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  45.49 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  46.33 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  42.73 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  40.55 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  38.49 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  39.11 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  33.5 
 
 		 245 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  31.95 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  32.37 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  34.63 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.65 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  33.65 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  32.06 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  30 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  27.83 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3936  hypothetical protein  27.96 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>