29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0814 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  100 
 
 		 230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  97.71 
 
 		 218 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  82.41 
 
 		 218 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  58 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  36.18 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  35.41 
 
 		 245 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  34.35 
 
 		 260 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  32.02 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  34.51 
 
 		 264 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  88.2  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  34.93 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  31.88 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  35.1 
 
 		 284 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  32.85 
 
 		 270 aa  85.9  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  33.62 
 
 		 280 aa  85.9  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  33.65 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  33.65 
 
 		 278 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  33.49 
 
 		 281 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  32.69 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  30.84 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  35.61 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  33.04 
 
 		 268 aa  78.2  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  37.34 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  34.15 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  31.73 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  33 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  31.43 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  31.43 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  29.61 
 
 		 285 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>