More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3008 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3008  magnesium chelatase, ChlI subunit  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000763869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  61.66 
 
 		 514 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  62.06 
 
 		 748 aa  308  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  45.99 
 
 		 512 aa  225  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  46 
 
 		 510 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  44.66 
 
 		 509 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  46.25 
 
 		 508 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  42.63 
 
 		 509 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  42.63 
 
 		 509 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  43.82 
 
 		 509 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  43.03 
 
 		 506 aa  202  7e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0214  magnesium chelatase ChlI subunit  42.63 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  43.03 
 
 		 509 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  42.8 
 
 		 509 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  43.14 
 
 		 506 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  40 
 
 		 505 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  41.22 
 
 		 512 aa  196  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  42.63 
 
 		 507 aa  195  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  39.53 
 
 		 509 aa  195  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  41.6 
 
 		 509 aa  193  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0115  Mg chelatase-related protein  42.8 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000542207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  42 
 
 		 505 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0337  Mg chelatase, subunit ChlI  42.8 
 
 		 390 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.293156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  41.22 
 
 		 513 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  42.46 
 
 		 513 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  41.83 
 
 		 509 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 510 aa  192  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  41.43 
 
 		 505 aa  191  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  44.44 
 
 		 510 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  41.9 
 
 		 516 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  46.22 
 
 		 514 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  39.3 
 
 		 509 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0280  magnesium chelatase, ChlI subunit  42.86 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  39.84 
 
 		 509 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  42.39 
 
 		 512 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  43.2 
 
 		 513 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  41.2 
 
 		 507 aa  183  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  42.99 
 
 		 512 aa  182  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3069  magnesium chelatase, ChlI subunit  43.03 
 
 		 308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0159361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  38.78 
 
 		 514 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  40.4 
 
 		 497 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  40.32 
 
 		 512 aa  182  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  42.8 
 
 		 510 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  41.73 
 
 		 510 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  40 
 
 		 497 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  39.6 
 
 		 504 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  41.34 
 
 		 511 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  41.94 
 
 		 506 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  42.91 
 
 		 496 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  42.86 
 
 		 509 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1676  Mg chelatase-like protein  36.95 
 
 		 507 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  40.5 
 
 		 504 aa  177  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  42.13 
 
 		 510 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  39.6 
 
 		 506 aa  177  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  39.2 
 
 		 507 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  40 
 
 		 513 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  38.91 
 
 		 504 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  38.25 
 
 		 512 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  37.35 
 
 		 507 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  40.4 
 
 		 534 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1762  Mg chelatase, subunit ChlI  40.64 
 
 		 497 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000904933  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  41.63 
 
 		 510 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  40.48 
 
 		 508 aa  176  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  41.13 
 
 		 498 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0215  ComM-related protein  40.08 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.888279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  40.32 
 
 		 504 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  42.86 
 
 		 485 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  40.62 
 
 		 499 aa  176  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  39.43 
 
 		 508 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  39.67 
 
 		 511 aa  175  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  40.08 
 
 		 511 aa  175  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  39.47 
 
 		 512 aa  175  8e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  40.77 
 
 		 518 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  37.94 
 
 		 520 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  40.32 
 
 		 497 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  40.15 
 
 		 515 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  38.11 
 
 		 512 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  39.68 
 
 		 501 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  36.86 
 
 		 506 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  37.36 
 
 		 530 aa  172  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  40.49 
 
 		 506 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  39.68 
 
 		 509 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  38.1 
 
 		 511 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  40.66 
 
 		 525 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  38.11 
 
 		 502 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  38.52 
 
 		 503 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  41.06 
 
 		 505 aa  171  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  41.6 
 
 		 495 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  38.43 
 
 		 516 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  38.96 
 
 		 501 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  38.8 
 
 		 502 aa  171  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  42.46 
 
 		 509 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  38.96 
 
 		 501 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  39.92 
 
 		 513 aa  170  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3674  Mg chelatase, subunit ChlI  40.4 
 
 		 507 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.411855 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  38.17 
 
 		 516 aa  169  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  36.26 
 
 		 516 aa  169  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  37.7 
 
 		 511 aa  169  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3940  Mg chelatase, subunit ChlI  39.29 
 
 		 508 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2021  magnesium chelatase ChlI subunit  38.55 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.756576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>