43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5116 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5116  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  318  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  76.47 
 
 		 165 aa  239  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  68.83 
 
 		 154 aa  219  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2001  hypothetical protein  71.43 
 
 		 154 aa  205  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0389  hypothetical protein  37.84 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000389815  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4773  hypothetical protein  44.57 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3760  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  34.69 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.410274 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07030  hypothetical protein  43.48 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.516082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0422  hypothetical protein  30.34 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0343  hypothetical protein  31.46 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.345751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1103  hypothetical protein  30.17 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3368  hypothetical protein  28.09 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0496  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  32.67 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000180452  decreased coverage  0.000517755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0485  hypothetical protein  27.53 
 
 		 192 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3057  hypothetical protein  28.09 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0866  hypothetical protein  29.38 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.015054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0473  hypothetical protein  29.21 
 
 		 192 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0449  hypothetical protein  26.97 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3881  hypothetical protein  27.53 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2379  hypothetical protein  28.87 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.148037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3810  hypothetical protein  27.53 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4006  hypothetical protein  27.53 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3546  hypothetical protein  26.97 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4489  hypothetical protein  29.05 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0484  hypothetical protein  26.97 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003685  hypothetical protein  28.74 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02136  hypothetical protein  28.74 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0474  hypothetical protein  26.4 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3387  hypothetical protein  28.09 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.480937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0473  hypothetical protein  29.05 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4879  hypothetical protein  39.33 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4856  hypothetical protein  39.33 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4848  hypothetical protein  39.33 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.732422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4873  hypothetical protein  39.33 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4988  hypothetical protein  39.33 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4487  hypothetical protein  39.33 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4468  hypothetical protein  39.33 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4634  hypothetical protein  39.33 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.206398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4567  hypothetical protein  39.33 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3412  hypothetical protein  38.2 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0388  hypothetical protein  39.33 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0929  hypothetical protein  31.29 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1506  hypothetical protein  28.1 
 
 		 248 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.956573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>