25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1103 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1103  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4489  hypothetical protein  67.37 
 
 
192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3387  hypothetical protein  70 
 
 
190 aa  270  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.480937  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0474  hypothetical protein  67.89 
 
 
192 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0485  hypothetical protein  67.89 
 
 
192 aa  270  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0343  hypothetical protein  66.84 
 
 
192 aa  269  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.345751  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3546  hypothetical protein  67.89 
 
 
192 aa  269  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0484  hypothetical protein  67.89 
 
 
192 aa  269  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3881  hypothetical protein  66.84 
 
 
192 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4006  hypothetical protein  66.84 
 
 
192 aa  267  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0473  hypothetical protein  66.84 
 
 
192 aa  266  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3057  hypothetical protein  65.26 
 
 
192 aa  266  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3810  hypothetical protein  66.84 
 
 
216 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0449  hypothetical protein  66.32 
 
 
219 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02136  hypothetical protein  67.2 
 
 
203 aa  265  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0866  hypothetical protein  66.14 
 
 
191 aa  263  8e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.015054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0473  hypothetical protein  65.26 
 
 
192 aa  262  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3368  hypothetical protein  65.79 
 
 
192 aa  262  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003685  hypothetical protein  67.2 
 
 
191 aa  261  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0422  hypothetical protein  60.53 
 
 
192 aa  241  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  32.18 
 
 
165 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  30.73 
 
 
154 aa  58.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5116  hypothetical protein  29.01 
 
 
154 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2001  hypothetical protein  28.24 
 
 
154 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0929  hypothetical protein  27.21 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>