27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02136 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02136  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003685  hypothetical protein  95.81 
 
 
191 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0866  hypothetical protein  81.68 
 
 
191 aa  332  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.015054  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3810  hypothetical protein  72.73 
 
 
216 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3057  hypothetical protein  71.2 
 
 
192 aa  296  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0449  hypothetical protein  72.22 
 
 
219 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3881  hypothetical protein  73.82 
 
 
192 aa  294  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4006  hypothetical protein  73.82 
 
 
192 aa  291  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3368  hypothetical protein  73.3 
 
 
192 aa  291  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3546  hypothetical protein  73.3 
 
 
192 aa  291  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0474  hypothetical protein  73.3 
 
 
192 aa  289  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0484  hypothetical protein  73.3 
 
 
192 aa  289  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0485  hypothetical protein  72.77 
 
 
192 aa  288  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4489  hypothetical protein  71.2 
 
 
192 aa  287  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0473  hypothetical protein  70.68 
 
 
192 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0343  hypothetical protein  70.9 
 
 
192 aa  283  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.345751  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0473  hypothetical protein  69.63 
 
 
192 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3387  hypothetical protein  70.53 
 
 
190 aa  280  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.480937  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0422  hypothetical protein  67.72 
 
 
192 aa  268  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1103  hypothetical protein  67.2 
 
 
190 aa  265  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  30.73 
 
 
165 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  31.28 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2001  hypothetical protein  29.14 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0929  hypothetical protein  29.73 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0496  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  28.65 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000180452  decreased coverage  0.000517755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5116  hypothetical protein  30.16 
 
 
154 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3760  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  25.14 
 
 
146 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.410274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>