43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0052 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  66.45 
 
 
165 aa  207  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5116  hypothetical protein  68.83 
 
 
154 aa  201  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2001  hypothetical protein  65.58 
 
 
154 aa  185  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0389  hypothetical protein  47.31 
 
 
127 aa  84.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000389815  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4773  hypothetical protein  47.83 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50804  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07030  hypothetical protein  44.57 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.516082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3760  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  32.43 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.410274 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3057  hypothetical protein  31.28 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0422  hypothetical protein  31.84 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0449  hypothetical protein  30.9 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3881  hypothetical protein  30.73 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3368  hypothetical protein  30.73 
 
 
192 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4006  hypothetical protein  30.73 
 
 
192 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0485  hypothetical protein  32.22 
 
 
192 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0343  hypothetical protein  32.78 
 
 
192 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.345751  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3810  hypothetical protein  30.73 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0474  hypothetical protein  31.28 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3546  hypothetical protein  31.67 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0484  hypothetical protein  31.67 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0496  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  40.43 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000180452  decreased coverage  0.000517755 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0866  hypothetical protein  30.73 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.015054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2379  hypothetical protein  29.14 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0473  hypothetical protein  31.84 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003685  hypothetical protein  31.28 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02136  hypothetical protein  31.28 
 
 
203 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0473  hypothetical protein  30.17 
 
 
192 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4489  hypothetical protein  30.51 
 
 
192 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1103  hypothetical protein  30.73 
 
 
190 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3387  hypothetical protein  29.28 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.480937  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0388  hypothetical protein  38.64 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4856  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4879  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4848  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.732422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4873  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4988  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4487  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4468  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4634  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.206398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4567  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3412  hypothetical protein  36.36 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1506  hypothetical protein  30.08 
 
 
248 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.956573  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0929  hypothetical protein  27.89 
 
 
196 aa  47.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>