27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0866 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0866  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.015054  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02136  hypothetical protein  81.68 
 
 
203 aa  332  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003685  hypothetical protein  81.68 
 
 
191 aa  330  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3057  hypothetical protein  69.11 
 
 
192 aa  284  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3881  hypothetical protein  69.11 
 
 
192 aa  276  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3368  hypothetical protein  69.11 
 
 
192 aa  276  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3546  hypothetical protein  69.63 
 
 
192 aa  275  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0485  hypothetical protein  69.63 
 
 
192 aa  275  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0449  hypothetical protein  69.11 
 
 
219 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0484  hypothetical protein  69.63 
 
 
192 aa  274  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3810  hypothetical protein  69.11 
 
 
216 aa  274  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0473  hypothetical protein  68.06 
 
 
192 aa  274  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4006  hypothetical protein  69.11 
 
 
192 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0474  hypothetical protein  68.59 
 
 
192 aa  271  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0343  hypothetical protein  67.72 
 
 
192 aa  270  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.345751  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0473  hypothetical protein  67.54 
 
 
192 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4489  hypothetical protein  65.97 
 
 
192 aa  270  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1103  hypothetical protein  66.14 
 
 
190 aa  263  8e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3387  hypothetical protein  67.37 
 
 
190 aa  263  8.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.480937  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0422  hypothetical protein  66.67 
 
 
192 aa  257  8e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  30.73 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  30.17 
 
 
165 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2001  hypothetical protein  28.32 
 
 
154 aa  51.6  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0929  hypothetical protein  27.53 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5116  hypothetical protein  29.38 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3760  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  25.27 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.410274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0496  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  26.97 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000180452  decreased coverage  0.000517755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>