28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0474 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0474  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0484  hypothetical protein  96.88 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3546  hypothetical protein  96.35 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0485  hypothetical protein  96.35 
 
 		 192 aa  381  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3810  hypothetical protein  93.23 
 
 		 216 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4006  hypothetical protein  93.75 
 
 		 192 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3881  hypothetical protein  93.75 
 
 		 192 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0449  hypothetical protein  92.71 
 
 		 219 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3368  hypothetical protein  92.19 
 
 		 192 aa  363  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4489  hypothetical protein  85.42 
 
 		 192 aa  344  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0473  hypothetical protein  86.46 
 
 		 192 aa  343  7e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0473  hypothetical protein  85.94 
 
 		 192 aa  343  8e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0343  hypothetical protein  84.9 
 
 		 192 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.345751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3057  hypothetical protein  80.21 
 
 		 192 aa  321  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02136  hypothetical protein  73.3 
 
 		 203 aa  289  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0422  hypothetical protein  73.44 
 
 		 192 aa  288  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003685  hypothetical protein  72.77 
 
 		 191 aa  284  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3387  hypothetical protein  72.11 
 
 		 190 aa  282  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.480937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0866  hypothetical protein  68.59 
 
 		 191 aa  271  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.015054  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1103  hypothetical protein  67.89 
 
 		 190 aa  270  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  31.28 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  30.17 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0929  hypothetical protein  30.19 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5116  hypothetical protein  27.48 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2001  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0496  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  25.4 
 
 		 158 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000180452  decreased coverage  0.000517755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3760  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  25.14 
 
 		 146 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.410274 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0389  hypothetical protein  30.09 
 
 		 127 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000389815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>