27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3387 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3387  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  390  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.480937  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3057  hypothetical protein  70 
 
 
192 aa  286  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0473  hypothetical protein  71.05 
 
 
192 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0474  hypothetical protein  72.11 
 
 
192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0484  hypothetical protein  71.58 
 
 
192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4006  hypothetical protein  71.05 
 
 
192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3546  hypothetical protein  71.58 
 
 
192 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4489  hypothetical protein  70 
 
 
192 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0485  hypothetical protein  71.05 
 
 
192 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3881  hypothetical protein  70.53 
 
 
192 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3810  hypothetical protein  70.53 
 
 
216 aa  279  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0473  hypothetical protein  69.47 
 
 
192 aa  280  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02136  hypothetical protein  70.53 
 
 
203 aa  280  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0449  hypothetical protein  70.53 
 
 
219 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3368  hypothetical protein  70 
 
 
192 aa  277  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0343  hypothetical protein  69.47 
 
 
192 aa  275  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.345751  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003685  hypothetical protein  70.53 
 
 
191 aa  274  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1103  hypothetical protein  70 
 
 
190 aa  270  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0866  hypothetical protein  67.37 
 
 
191 aa  263  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.015054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0422  hypothetical protein  63.16 
 
 
192 aa  254  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  29.28 
 
 
154 aa  58.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  29.71 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5116  hypothetical protein  29.01 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0929  hypothetical protein  27.4 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3760  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  25.71 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.410274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2001  hypothetical protein  29.2 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0496  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  27.84 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000180452  decreased coverage  0.000517755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>