24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0929 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0929  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0422  hypothetical protein  30.61 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0343  hypothetical protein  31.37 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.345751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3368  hypothetical protein  31.37 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0484  hypothetical protein  28.82 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3881  hypothetical protein  31.37 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0485  hypothetical protein  29.41 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3546  hypothetical protein  29.41 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4489  hypothetical protein  32.26 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4006  hypothetical protein  30.72 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0474  hypothetical protein  30.19 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3810  hypothetical protein  30.72 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0473  hypothetical protein  29.53 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0473  hypothetical protein  29.03 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0449  hypothetical protein  28.76 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02136  hypothetical protein  29.73 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0866  hypothetical protein  27.53 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.015054  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3387  hypothetical protein  27.4 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.480937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003685  hypothetical protein  29.05 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3057  hypothetical protein  27.74 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  27.89 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1103  hypothetical protein  27.21 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  31.29 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5116  hypothetical protein  30.15 
 
 		 154 aa  45.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.456316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>