27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0473 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0473  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4489  hypothetical protein  92.71 
 
 		 192 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0473  hypothetical protein  90.62 
 
 		 192 aa  358  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0343  hypothetical protein  89.06 
 
 		 192 aa  351  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.345751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3546  hypothetical protein  85.42 
 
 		 192 aa  344  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3810  hypothetical protein  85.42 
 
 		 216 aa  343  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4006  hypothetical protein  85.42 
 
 		 192 aa  343  7e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0474  hypothetical protein  85.94 
 
 		 192 aa  343  8e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3881  hypothetical protein  85.42 
 
 		 192 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0485  hypothetical protein  84.9 
 
 		 192 aa  342  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0449  hypothetical protein  84.9 
 
 		 219 aa  341  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0484  hypothetical protein  84.9 
 
 		 192 aa  340  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3368  hypothetical protein  84.38 
 
 		 192 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3057  hypothetical protein  76.04 
 
 		 192 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0422  hypothetical protein  71.88 
 
 		 192 aa  287  7e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3387  hypothetical protein  71.05 
 
 		 190 aa  285  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.480937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02136  hypothetical protein  69.63 
 
 		 203 aa  281  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003685  hypothetical protein  69.11 
 
 		 191 aa  278  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0866  hypothetical protein  68.06 
 
 		 191 aa  274  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.015054  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1103  hypothetical protein  66.84 
 
 		 190 aa  266  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  30.17 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0929  hypothetical protein  29.03 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  29.61 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5116  hypothetical protein  28.24 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2001  hypothetical protein  29.23 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0496  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  24.87 
 
 		 158 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000180452  decreased coverage  0.000517755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3760  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  26.23 
 
 		 146 aa  44.7  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.410274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>