28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3057 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3057  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4006  hypothetical protein  80.73 
 
 		 192 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3881  hypothetical protein  80.21 
 
 		 192 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0474  hypothetical protein  80.21 
 
 		 192 aa  321  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3810  hypothetical protein  80.21 
 
 		 216 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4489  hypothetical protein  78.12 
 
 		 192 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3546  hypothetical protein  78.65 
 
 		 192 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3368  hypothetical protein  78.65 
 
 		 192 aa  316  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0485  hypothetical protein  78.12 
 
 		 192 aa  315  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0484  hypothetical protein  78.65 
 
 		 192 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0449  hypothetical protein  78.12 
 
 		 219 aa  313  9e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0473  hypothetical protein  77.08 
 
 		 192 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0473  hypothetical protein  76.04 
 
 		 192 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0343  hypothetical protein  75.52 
 
 		 192 aa  309  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.345751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02136  hypothetical protein  71.2 
 
 		 203 aa  296  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003685  hypothetical protein  70.68 
 
 		 191 aa  291  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0422  hypothetical protein  71.35 
 
 		 192 aa  287  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3387  hypothetical protein  70 
 
 		 190 aa  286  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.480937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0866  hypothetical protein  69.11 
 
 		 191 aa  284  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.015054  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1103  hypothetical protein  65.26 
 
 		 190 aa  266  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  31.28 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  30.73 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2001  hypothetical protein  28.81 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3760  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  24.21 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.410274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5116  hypothetical protein  28.79 
 
 		 154 aa  51.2  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0929  hypothetical protein  27.74 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0496  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  26.37 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000180452  decreased coverage  0.000517755 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0389  hypothetical protein  28.32 
 
 		 127 aa  41.6  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000389815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>