26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4489 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4489  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0473  hypothetical protein  92.71 
 
 		 192 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0473  hypothetical protein  86.98 
 
 		 192 aa  353  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0343  hypothetical protein  85.42 
 
 		 192 aa  347  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.345751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3810  hypothetical protein  86.46 
 
 		 216 aa  345  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4006  hypothetical protein  86.46 
 
 		 192 aa  345  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3881  hypothetical protein  86.46 
 
 		 192 aa  344  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0474  hypothetical protein  85.42 
 
 		 192 aa  344  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3546  hypothetical protein  83.85 
 
 		 192 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0485  hypothetical protein  83.33 
 
 		 192 aa  339  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0449  hypothetical protein  83.85 
 
 		 219 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0484  hypothetical protein  83.33 
 
 		 192 aa  338  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3368  hypothetical protein  83.85 
 
 		 192 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3057  hypothetical protein  78.12 
 
 		 192 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02136  hypothetical protein  71.2 
 
 		 203 aa  287  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0422  hypothetical protein  70.83 
 
 		 192 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003685  hypothetical protein  71.2 
 
 		 191 aa  285  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3387  hypothetical protein  70 
 
 		 190 aa  281  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.480937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1103  hypothetical protein  67.37 
 
 		 190 aa  272  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0866  hypothetical protein  65.97 
 
 		 191 aa  270  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.015054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  30.51 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0929  hypothetical protein  32.26 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5116  hypothetical protein  29.01 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  29.61 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2001  hypothetical protein  26.92 
 
 		 154 aa  47.8  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3760  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  27.32 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.410274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>