28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0422 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0422  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0343  hypothetical protein  74.48 
 
 		 192 aa  298  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.345751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3881  hypothetical protein  74.48 
 
 		 192 aa  294  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4006  hypothetical protein  74.48 
 
 		 192 aa  293  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3810  hypothetical protein  74.48 
 
 		 216 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3368  hypothetical protein  74.48 
 
 		 192 aa  290  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0449  hypothetical protein  73.44 
 
 		 219 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0474  hypothetical protein  73.44 
 
 		 192 aa  288  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0473  hypothetical protein  73.44 
 
 		 192 aa  288  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0473  hypothetical protein  71.88 
 
 		 192 aa  287  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3057  hypothetical protein  71.35 
 
 		 192 aa  287  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3546  hypothetical protein  72.92 
 
 		 192 aa  286  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0485  hypothetical protein  72.4 
 
 		 192 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0484  hypothetical protein  72.92 
 
 		 192 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4489  hypothetical protein  70.83 
 
 		 192 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02136  hypothetical protein  67.72 
 
 		 203 aa  268  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003685  hypothetical protein  67.2 
 
 		 191 aa  262  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0866  hypothetical protein  66.67 
 
 		 191 aa  257  8e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.015054  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3387  hypothetical protein  63.16 
 
 		 190 aa  254  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.480937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1103  hypothetical protein  60.53 
 
 		 190 aa  241  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  31.84 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  31.98 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0929  hypothetical protein  30.61 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2001  hypothetical protein  31.07 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353947  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5116  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3760  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  27.42 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.410274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0496  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  27.23 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000180452  decreased coverage  0.000517755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07030  hypothetical protein  30.97 
 
 		 129 aa  42  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.516082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>