22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1506 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1506  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.956573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  40 
 
 		 461 aa  131  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0780  hypothetical protein  41.82 
 
 		 462 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.680411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  39.76 
 
 		 460 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3412  hypothetical protein  36.42 
 
 		 142 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4567  hypothetical protein  35.37 
 
 		 140 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4879  hypothetical protein  34.76 
 
 		 140 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4856  hypothetical protein  34.76 
 
 		 140 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4848  hypothetical protein  34.76 
 
 		 140 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.732422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4873  hypothetical protein  34.76 
 
 		 140 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4988  hypothetical protein  34.76 
 
 		 140 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4487  hypothetical protein  34.76 
 
 		 143 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4468  hypothetical protein  34.76 
 
 		 140 aa  92.8  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4634  hypothetical protein  34.76 
 
 		 140 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.206398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0388  hypothetical protein  34.76 
 
 		 140 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0496  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  29.46 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000180452  decreased coverage  0.000517755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0052  hypothetical protein  30.08 
 
 		 154 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455768  normal  0.402924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4773  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50804  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07030  hypothetical protein  52 
 
 		 129 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.516082  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2426  Protein of unknown function DUF2166  28.93 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536876  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0389  hypothetical protein  42.11 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000389815  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3760  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  21.74 
 
 		 146 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.410274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>