23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0094 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  100 
 
 		 213 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  30.6 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  31.54 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  29 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  30.84 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  37.32 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  35.76 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  31.63 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  28.9 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  31.18 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  29.29 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  31.31 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  33.56 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  29.13 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  37.61 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  36.63 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  32.73 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  29.09 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  35.48 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  28.67 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  25.85 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  25.58 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  25.97 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>