23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0523 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  53.67 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  47.98 
 
 
212 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  46.19 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  44.76 
 
 
221 aa  182  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  43.44 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  44.02 
 
 
202 aa  168  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  45.96 
 
 
360 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  45.16 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  41.26 
 
 
222 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  39.91 
 
 
223 aa  158  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  39.82 
 
 
223 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  41.58 
 
 
238 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  43.39 
 
 
197 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  42.25 
 
 
219 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  37.5 
 
 
236 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  42.36 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  37.44 
 
 
225 aa  142  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  38.84 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  38.17 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  35.83 
 
 
250 aa  121  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  28.37 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  28.67 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>