23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0863 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  100 
 
 
245 aa  511  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  70.21 
 
 
236 aa  342  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  54.33 
 
 
360 aa  235  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  45.27 
 
 
221 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  44.87 
 
 
222 aa  193  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  43.85 
 
 
223 aa  190  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  43.85 
 
 
225 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  43.15 
 
 
230 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  45.5 
 
 
238 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  41.98 
 
 
224 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  47.21 
 
 
232 aa  176  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  42.45 
 
 
219 aa  174  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  41.56 
 
 
223 aa  172  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  42.72 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  43.5 
 
 
197 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  39.59 
 
 
251 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  42.29 
 
 
207 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  42.36 
 
 
223 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  41.5 
 
 
212 aa  144  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  41.46 
 
 
217 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  32.26 
 
 
228 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  34.13 
 
 
202 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  29.09 
 
 
213 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>