23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1157 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  519  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  51.87 
 
 
223 aa  231  9e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  45.5 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  47.85 
 
 
217 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  44.68 
 
 
221 aa  169  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  45.74 
 
 
212 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  41.35 
 
 
360 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  44.92 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  39.59 
 
 
245 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  38.05 
 
 
225 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  42.47 
 
 
223 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  38.66 
 
 
224 aa  148  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  38.89 
 
 
223 aa  148  9e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  37.26 
 
 
236 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  38.03 
 
 
232 aa  145  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  38.5 
 
 
222 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  39 
 
 
238 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  41.05 
 
 
197 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  37.88 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  36.17 
 
 
202 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  36.73 
 
 
250 aa  118  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  29.71 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  26.43 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>