23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0481 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  100 
 
 		 221 aa  455  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  57.08 
 
 		 232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  57.14 
 
 		 360 aa  226  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  45.27 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  49.25 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  46.73 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  49.73 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  46.02 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  41.67 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  48.11 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  44.97 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  48.09 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  42.92 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  47.03 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  42.72 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  47.31 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  45.41 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  44.57 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  43.15 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  41.94 
 
 		 250 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  31.36 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  28.43 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  37.32 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>