23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2565 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  66.06 
 
 
223 aa  311  6.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  60.18 
 
 
224 aa  291  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  58.59 
 
 
225 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  56.22 
 
 
222 aa  250  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  44.3 
 
 
245 aa  185  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  44.5 
 
 
360 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  43.86 
 
 
221 aa  180  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  41.56 
 
 
230 aa  179  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  41.92 
 
 
217 aa  176  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  48.09 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  39.91 
 
 
223 aa  168  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  42.79 
 
 
236 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  44.39 
 
 
207 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  41.58 
 
 
223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  44.38 
 
 
212 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  41.54 
 
 
250 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  40.11 
 
 
219 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  42.11 
 
 
197 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  36.48 
 
 
251 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  32.61 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  32.74 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  37.61 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>