23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2181 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  100 
 
 
223 aa  463  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  51.87 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  47.64 
 
 
230 aa  206  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  45.18 
 
 
225 aa  179  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  42.72 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  41.56 
 
 
245 aa  172  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  44.39 
 
 
360 aa  171  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  39.57 
 
 
236 aa  168  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  42.13 
 
 
223 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  44.92 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  41.09 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  40.85 
 
 
222 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  38.64 
 
 
224 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  43.78 
 
 
223 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  38.89 
 
 
212 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  38.79 
 
 
232 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  41.08 
 
 
207 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  40.7 
 
 
219 aa  147  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  40.31 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  38.27 
 
 
250 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  35.94 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  29 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  28.51 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>