23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1658 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  41.82 
 
 
217 aa  169  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  44.44 
 
 
223 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  45.2 
 
 
212 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  45.09 
 
 
207 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  31.36 
 
 
221 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  37.11 
 
 
230 aa  124  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  32.31 
 
 
232 aa  121  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  34.93 
 
 
360 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  35.55 
 
 
222 aa  114  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  35.94 
 
 
223 aa  114  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  34.23 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  32.61 
 
 
238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  34.65 
 
 
224 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  35.64 
 
 
251 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  33.5 
 
 
197 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  34.13 
 
 
245 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  33.51 
 
 
219 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  31.62 
 
 
225 aa  99  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  31.1 
 
 
236 aa  97.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  28.86 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  27.36 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  25.97 
 
 
213 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>