23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0884 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  58.59 
 
 
238 aa  258  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  55.8 
 
 
223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  54.98 
 
 
222 aa  248  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  54.05 
 
 
224 aa  246  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  43.85 
 
 
245 aa  190  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  46.02 
 
 
221 aa  187  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  45.37 
 
 
360 aa  180  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  45.18 
 
 
223 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  44.05 
 
 
230 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  42.92 
 
 
236 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  48.13 
 
 
207 aa  172  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  43.89 
 
 
232 aa  168  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  39.46 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  41.33 
 
 
219 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  43.55 
 
 
212 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  45.83 
 
 
197 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  38.05 
 
 
251 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  42.27 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  39.09 
 
 
223 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  29.77 
 
 
228 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  31.62 
 
 
202 aa  99  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  31.54 
 
 
213 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>