23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1563 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  100 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  70.21 
 
 		 245 aa  342  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  55.29 
 
 		 360 aa  241  7e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  49.25 
 
 		 221 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  41.7 
 
 		 232 aa  184  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  42.92 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  42.55 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  41.45 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  41.74 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  43.2 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  39.57 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  42.79 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  43.4 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  40.1 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  39.24 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  39.2 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  40.5 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  40.89 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  35.84 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  40.3 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  32.16 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  31.1 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  25.85 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>