23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1586 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  49.27 
 
 
360 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  38.87 
 
 
236 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  42.72 
 
 
245 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  40.31 
 
 
230 aa  154  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  41.54 
 
 
238 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  39.49 
 
 
223 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  41.94 
 
 
221 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  42.27 
 
 
222 aa  149  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  42.27 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  38.34 
 
 
219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  40.76 
 
 
197 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  38.14 
 
 
224 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  38.12 
 
 
232 aa  135  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  34.16 
 
 
217 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  38.27 
 
 
223 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  35.83 
 
 
223 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  36.87 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  36.11 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  36.73 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  29.44 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  28.86 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  28.9 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>