23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2976 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  473  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  32.16 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  32.74 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  32.26 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  28.63 
 
 		 360 aa  105  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  29.49 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  29.77 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  32.56 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  30.19 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  28.7 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  29.44 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  26.64 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  28.5 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  28.37 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  28.51 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  28.43 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  28.37 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  28.16 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  29.19 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  29.41 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  25.99 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  27.36 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  25.58 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>