More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0860 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0860  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 87 aa  177  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0969  30S ribosomal protein S15  97.7 
 
 		 87 aa  174  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_842  ribosomal protein S15  97.7 
 
 		 87 aa  174  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00265541  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  55.42 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2817  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2686  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 		 91 aa  95.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  54.76 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  54.12 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0568  ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 87 aa  93.6  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3386  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388546 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  54.02 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  53.66 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0834  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  51.81 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1823  30S ribosomal protein S15  52.94 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000243315  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  56.1 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  50.57 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  51.72 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  53.01 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  51.19 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3558  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  51.19 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  50 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  48.81 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0533  ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 87 aa  88.2  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  50 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  48.81 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  49.4 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  52.44 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3881  ribosomal protein S15  51.19 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  50 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  52.38 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  51.19 
 
 		 88 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  50.59 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 88 aa  86.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  47.62 
 
 		 89 aa  87  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  48.81 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  85.9  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  48.28 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3057  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  49.41 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  51.19 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>