50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2799 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  100 
 
 		 204 aa  427  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  89.26 
 
 		 179 aa  275  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  41.1 
 
 		 231 aa  95.1  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1739  hypothetical protein  61.8 
 
 		 277 aa  94.7  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.326437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2796  hypothetical protein  61.8 
 
 		 277 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  61.29 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  46 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  39.64 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  38 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  36.67 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  37.84 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  41.88 
 
 		 311 aa  81.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  37.9 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  34.51 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  42.72 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  37.01 
 
 		 290 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  36.15 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  30 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  40.37 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  36.54 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  36.54 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  37.38 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  38.39 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  39.42 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  36.36 
 
 		 227 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  32.8 
 
 		 380 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  30.93 
 
 		 255 aa  72  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  54.29 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  36.45 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  34.96 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  36.45 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  37.38 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  50.72 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  38.61 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  27.59 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  31.25 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  50 
 
 		 72 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  36.11 
 
 		 172 aa  62  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  36.96 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  36.96 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  35.65 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  31.37 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  27.33 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  38.16 
 
 		 128 aa  53.1  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  31.39 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  30.21 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  30.21 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  38.82 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>