43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2989 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  100 
 
 		 231 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  47.66 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2869  hypothetical protein  29.82 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000149564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  41.88 
 
 		 282 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  41.1 
 
 		 204 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  42.16 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  35.39 
 
 		 179 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  47.32 
 
 		 188 aa  92  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  45.83 
 
 		 188 aa  90.5  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  44.79 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  46.67 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0851  AntA/AntB antirepressor domain protein  28.95 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  41.49 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  36.88 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  39.64 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  32.86 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  36.44 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  42.31 
 
 		 172 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  45.26 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  41.24 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  39 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  36.54 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  46.48 
 
 		 91 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  35.9 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  39.6 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  31.9 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  35.34 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  32.14 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  32.14 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  38.37 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  39.78 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  25 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  29.25 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  43.06 
 
 		 165 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  29.25 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  40.74 
 
 		 128 aa  52.8  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  36.36 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  29.47 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  29.47 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  32.43 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  42.86 
 
 		 72 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  28.57 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  28.74 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>