46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1464 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  39.5 
 
 
243 aa  116  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  41.71 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  35.75 
 
 
276 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  40.11 
 
 
188 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  43.93 
 
 
380 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  44.37 
 
 
188 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  44.44 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  46.88 
 
 
282 aa  89.4  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  47.83 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  38 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  30.73 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  35.14 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  46.39 
 
 
200 aa  79  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  44.12 
 
 
227 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  36.29 
 
 
172 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0647  carbamoyl-phosphate synthase large chain  63.79 
 
 
77 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.723293  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  44.94 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  41.24 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  39.64 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  35.58 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  33.33 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  39.36 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  41.67 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  32.34 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  32.28 
 
 
243 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  32.28 
 
 
250 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  32.69 
 
 
194 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  30.71 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1237  hypothetical protein  26.56 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  38.61 
 
 
184 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  26.44 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1302  hypothetical protein  25.5 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  25.97 
 
 
233 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2768  hypothetical protein  28.26 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.703396  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  40 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  41.89 
 
 
91 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2843  hypothetical protein  24.16 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2072  hypothetical protein  28 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.266312  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  42.03 
 
 
72 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  25.97 
 
 
236 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  40.98 
 
 
128 aa  48.5  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  25.48 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  25.48 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  25.48 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  25.48 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>