32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2652 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1864  prophage antirepressor  38.46 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.886046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  39.84 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  38.33 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  37.01 
 
 		 204 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  36.75 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  33.33 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  33.04 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  35.59 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  33.33 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  29.75 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  31.71 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  30.89 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  33.88 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  30.52 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  32.56 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  34.34 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  32.14 
 
 		 227 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  31.62 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  39.78 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  33.04 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  26.49 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  30.69 
 
 		 194 aa  52.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  27.97 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  38.04 
 
 		 167 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  30.69 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  30.61 
 
 		 194 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  25.63 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2408  phage-encoded protein-like  23.18 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  24.79 
 
 		 184 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  23.12 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  32.41 
 
 		 172 aa  42.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>