43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_a011 on replicon NC_012040
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  68 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  53.29 
 
 		 188 aa  147  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  60 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a013  putative antirepressor, BRO family  100 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  48.72 
 
 		 276 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  42.42 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  44.44 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  45.63 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  45.45 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  41.46 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  41.07 
 
 		 380 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  36.44 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  35.07 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  43.56 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  41.35 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  34.92 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  38.39 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  40.78 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  43 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  41.18 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  40 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  39.09 
 
 		 252 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  39.51 
 
 		 91 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  33.88 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  32.8 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  31.5 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  39.42 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  30.32 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  33.64 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  33.64 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  33.06 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  28.12 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  28.12 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  29.66 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  37.35 
 
 		 128 aa  50.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  29.66 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  39.24 
 
 		 72 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  41.98 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  31.09 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  29.41 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  29.79 
 
 		 247 aa  42  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  29.79 
 
 		 247 aa  42  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>