38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1666 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  100 
 
 		 194 aa  406  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  86.01 
 
 		 194 aa  347  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  82.38 
 
 		 194 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  45.28 
 
 		 380 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  45.37 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  34.59 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  40.52 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  43.75 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  31.07 
 
 		 284 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  36.28 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  33.96 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  40.68 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  36.54 
 
 		 311 aa  74.7  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  40.4 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  40.18 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  36.45 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  36.54 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  34.02 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  39.36 
 
 		 232 aa  67  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  40.78 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  36.45 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  37.74 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  36.54 
 
 		 276 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  32.43 
 
 		 252 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  38.83 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  31.2 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  41.67 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  41.67 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  38.16 
 
 		 91 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  27.64 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  27.64 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  30.69 
 
 		 290 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  30.25 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  30.36 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  46.34 
 
 		 128 aa  46.2  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  31.45 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>