23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0869 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  100 
 
 		 231 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  52.69 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  50.54 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  50.54 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6402  anti-repressor protein  46.59 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  31.45 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  43.27 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  41.86 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1690  uncharacterized phage-encoded protein  32.67 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  31.39 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3221  hypothetical protein  32.99 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.393793  normal  0.185811 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  41.43 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0368  hypothetical protein  40.58 
 
 		 125 aa  49.3  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  30.66 
 
 		 179 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2848  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  43.4 
 
 		 188 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  30.17 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  28.74 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  30.17 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  32.35 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1250  hypothetical protein  30.28 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000878472  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  28.57 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  29.41 
 
 		 194 aa  42.4  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>