16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3221 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3221  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.393793  normal  0.185811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1690  uncharacterized phage-encoded protein  69.35 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0676  hypothetical protein  45.52 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  hitchhiker  0.000000616618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  59 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3960  hypothetical protein  50.83 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0653  hypothetical protein  41.67 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0219552  hitchhiker  0.0000163196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1054  hypothetical protein  37.7 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250524  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  38.36 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  42.53 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6402  anti-repressor protein  43.18 
 
 		 88 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  32.99 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  30.82 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  31.76 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  31.76 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  24.71 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  27.34 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>