39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2343 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  642    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  39.29 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  39.84 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  47.01 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  47.83 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  41.88 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  41.59 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  39.45 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  36.84 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  41.03 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  39.62 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  31.48 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  37.27 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  39.84 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  45.26 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  44.04 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  36.54 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  31.48 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  39.05 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  33.62 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  41.12 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  36.64 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  39.29 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  39.25 
 
 		 172 aa  67  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  41.28 
 
 		 256 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  32.58 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  40 
 
 		 194 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  28.83 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  40.22 
 
 		 165 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  25.81 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  28.18 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  24.8 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  28.18 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  24.8 
 
 		 250 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  28.97 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  42.25 
 
 		 91 aa  49.3  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  40.28 
 
 		 72 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  26.56 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  52.63 
 
 		 128 aa  47.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>