38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3463 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  100 
 
 		 233 aa  481  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  87.71 
 
 		 236 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  71.49 
 
 		 242 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  71.49 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  43.36 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  43.36 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  32.9 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  35.03 
 
 		 259 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  39.64 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  38.18 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  33.57 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  31.58 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  34.35 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  32.8 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  39.23 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  34.51 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  31.09 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  33.02 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  39.44 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  36.36 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  28.57 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  38.54 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  38.54 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  29.94 
 
 		 380 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  26.11 
 
 		 282 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  30.97 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  28.18 
 
 		 207 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  25.97 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  25.81 
 
 		 311 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  30.25 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  28.57 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  26.19 
 
 		 284 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  29 
 
 		 276 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  34.25 
 
 		 72 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  23.12 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  30.14 
 
 		 91 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  28.32 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  28.32 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>