14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2796 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2796  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  568  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1739  hypothetical protein  94.22 
 
 
277 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.326437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  61.8 
 
 
204 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  38.24 
 
 
285 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2424  anti-repressor protein Ant  26.36 
 
 
315 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  26.85 
 
 
255 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3525  anti-repressor protein Ant  31.07 
 
 
189 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860875  hitchhiker  0.000134642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1530  anti-repressor protein Ant  30.1 
 
 
189 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1775  anti-repressor protein Ant  30.1 
 
 
189 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271275  normal  0.0239228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2253  anti-repressor protein Ant  30.1 
 
 
189 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000406549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3142  anti-repressor protein Ant  30.1 
 
 
189 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.682869  hitchhiker  0.00000000668139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0847  hypothetical protein  37.35 
 
 
210 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000160526  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3322  hypothetical protein  29.7 
 
 
183 aa  45.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  54.29 
 
 
179 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>