More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3605 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3605  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.521462  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0342  transcriptional regulator, GntR family  51.84 
 
 		 245 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0335  transcriptional regulator, GntR family  51.02 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 240 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.39 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  29.39 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  29.39 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  29.39 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  29.39 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 241 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  35.37 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  32.44 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  30.29 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  29.44 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.15 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 243 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 242 aa  85.9  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 249 aa  85.5  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 257 aa  85.5  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>