53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2220 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2220  citrate lyase ligase  100 
 
 		 347 aa  719    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2322  citrate lyase ligase  79.25 
 
 		 347 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2025  citrate lyase ligase  72 
 
 		 354 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1752  citrate lyase ligase  70.86 
 
 		 354 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3375  citrate lyase ligase  55.93 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2410  citrate lyase ligase  54.92 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0323  citrate (pro-3S)-lyase ligase  49.07 
 
 		 356 aa  328  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  51.09 
 
 		 343 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.286677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0669  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.16 
 
 		 352 aa  323  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.850231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3026  citrate lyase ligase  50.16 
 
 		 352 aa  323  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0637  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.16 
 
 		 352 aa  323  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00586  citrate lyase synthetase  50.16 
 
 		 352 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00575  hypothetical protein  50.16 
 
 		 352 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3007  citrate lyase ligase  50.16 
 
 		 352 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.52417  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0062  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  51.09 
 
 		 343 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.93415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0065  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.78 
 
 		 343 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.78 
 
 		 343 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  0.752435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0532  citrate lyase synthetase  49.84 
 
 		 352 aa  321  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0064  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  51.09 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0706  citrate lyase synthetase  49.53 
 
 		 352 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3171  citrate lyase ligase  48.45 
 
 		 357 aa  311  9e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.16085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0724  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  49.21 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0664  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  49.21 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0783  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  49.21 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.46183  normal  0.28967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0678  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  49.21 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0737  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  49.21 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1162  citrate lyase ligase  41.32 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.161985  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1673  citrate lyase ligase  41.12 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04660  (Citrate (pro-3S)-lyase) ligase  35.67 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0420  citrate lyase synthetase  36.53 
 
 		 348 aa  203  4e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1088  citrate lyase ligase  39.35 
 
 		 338 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3947  citrate lyase ligase  38.73 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3862  citrate lyase ligase  40.55 
 
 		 333 aa  196  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1522  citrate lyase ligase  33.33 
 
 		 342 aa  193  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05301  citrate lyase ligase  39.9 
 
 		 262 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0439  cytidyltransferase-related domain protein  41.8 
 
 		 688 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  33.7 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.77 
 
 		 151 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  35 
 
 		 161 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0190  phosphopantetheine adenylyltransferase  33.78 
 
 		 159 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2069  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  29.09 
 
 		 167 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1945  phosphopantetheine adenylyltransferase  30.69 
 
 		 170 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1991  phosphopantetheine adenylyltransferase  34.72 
 
 		 158 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1925  phosphopantetheine adenylyltransferase  34.72 
 
 		 158 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2108  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 		 148 aa  43.5  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2632  phosphopantetheine adenylyltransferase  31.34 
 
 		 163 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000126896  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1103  N-acetylglutamate synthase  34.72 
 
 		 440 aa  43.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.540979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4030  phosphopantetheine adenylyltransferase  31.34 
 
 		 163 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0157676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1210  phosphopantetheine adenylyltransferase  31.34 
 
 		 163 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1206  phosphopantetheine adenylyltransferase  28.77 
 
 		 160 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3756  phosphopantetheine adenylyltransferase  31.34 
 
 		 163 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1184  phosphopantetheine adenylyltransferase  28.77 
 
 		 160 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0454374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3584  N-acetylglutamate synthase  31.71 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.591835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>