37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1673 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1673  citrate lyase ligase  100 
 
 
347 aa  694    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1162  citrate lyase ligase  40.13 
 
 
345 aa  248  8e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.161985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04660  (Citrate (pro-3S)-lyase) ligase  36.72 
 
 
359 aa  222  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1088  citrate lyase ligase  39.45 
 
 
338 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2025  citrate lyase ligase  38.85 
 
 
354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2322  citrate lyase ligase  41.58 
 
 
347 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3947  citrate lyase ligase  40.8 
 
 
333 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1752  citrate lyase ligase  38.54 
 
 
354 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2220  citrate lyase ligase  41.12 
 
 
347 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3862  citrate lyase ligase  40 
 
 
333 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0420  citrate lyase synthetase  39.16 
 
 
348 aa  209  6e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3375  citrate lyase ligase  39.93 
 
 
341 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3171  citrate lyase ligase  36.3 
 
 
357 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.16085  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0724  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  36.21 
 
 
358 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0664  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  36.21 
 
 
358 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0783  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  36.21 
 
 
358 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.46183  normal  0.28967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0678  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  36.21 
 
 
358 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0737  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  36.21 
 
 
358 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3007  citrate lyase ligase  33.64 
 
 
352 aa  189  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.52417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0669  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  33.64 
 
 
352 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.850231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0532  citrate lyase synthetase  33.94 
 
 
352 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3026  citrate lyase ligase  33.64 
 
 
352 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0637  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  33.64 
 
 
352 aa  189  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00586  citrate lyase synthetase  33.64 
 
 
352 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00575  hypothetical protein  33.64 
 
 
352 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0706  citrate lyase synthetase  33.33 
 
 
352 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0323  citrate (pro-3S)-lyase ligase  34.92 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0064  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  37.16 
 
 
343 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1522  citrate lyase ligase  34.81 
 
 
342 aa  180  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  36.86 
 
 
343 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  36.86 
 
 
343 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  0.752435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0062  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  36.86 
 
 
343 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.93415  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0065  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  36.56 
 
 
343 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2410  citrate lyase ligase  36.16 
 
 
364 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0439  cytidyltransferase-related domain protein  32.57 
 
 
688 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05301  citrate lyase ligase  36.56 
 
 
262 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0668  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.07 
 
 
160 aa  47  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>