53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0323 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0323  citrate (pro-3S)-lyase ligase  100 
 
 		 356 aa  746    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3007  citrate lyase ligase  50.58 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.52417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0669  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.58 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.850231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3026  citrate lyase ligase  50.58 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0637  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.58 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0706  citrate lyase synthetase  50.58 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00586  citrate lyase synthetase  50.58 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00575  hypothetical protein  50.58 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0532  citrate lyase synthetase  50.29 
 
 		 352 aa  348  8e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3171  citrate lyase ligase  50.45 
 
 		 357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.16085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0724  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.15 
 
 		 358 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0664  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.15 
 
 		 358 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0783  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.15 
 
 		 358 aa  331  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.46183  normal  0.28967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0737  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.15 
 
 		 358 aa  331  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0678  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.15 
 
 		 358 aa  331  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2410  citrate lyase ligase  47.85 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2220  citrate lyase ligase  49.07 
 
 		 347 aa  328  8e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  51.57 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.286677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0065  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  51.57 
 
 		 343 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0062  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  51.89 
 
 		 343 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.93415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  51.89 
 
 		 343 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  0.752435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0064  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  51.57 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2322  citrate lyase ligase  45.81 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3375  citrate lyase ligase  44.95 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1752  citrate lyase ligase  45.12 
 
 		 354 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2025  citrate lyase ligase  44.48 
 
 		 354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1162  citrate lyase ligase  40.19 
 
 		 345 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.161985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04660  (Citrate (pro-3S)-lyase) ligase  34.57 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0420  citrate lyase synthetase  35.91 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1673  citrate lyase ligase  34.92 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1088  citrate lyase ligase  34.48 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3862  citrate lyase ligase  35.44 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3947  citrate lyase ligase  35.44 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190715 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0439  cytidyltransferase-related domain protein  43.2 
 
 		 688 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973944 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1522  citrate lyase ligase  32.21 
 
 		 342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05301  citrate lyase ligase  30.99 
 
 		 262 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 		 189 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  29.81 
 
 		 163 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1675  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 		 182 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03220  hypothetical protein  28.21 
 
 		 165 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.554181  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2167  phosphopantetheine adenylyltransferase  37.5 
 
 		 160 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1184  phosphopantetheine adenylyltransferase  34.38 
 
 		 160 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0454374  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1206  phosphopantetheine adenylyltransferase  34.38 
 
 		 160 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361854  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1945  phosphopantetheine adenylyltransferase  30.09 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1991  phosphopantetheine adenylyltransferase  30.09 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 		 151 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1925  phosphopantetheine adenylyltransferase  30.09 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4196  phosphopantetheine adenylyltransferase  35.94 
 
 		 160 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 156 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0596  N-acetylglutamate synthase  30.19 
 
 		 188 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0558798  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0715  phosphopantetheine adenylyltransferase  35.09 
 
 		 161 aa  43.9  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.429176  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77083  glucosamine-phosphate N-acetyltransferase  27.59 
 
 		 151 aa  43.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0392  GCN5-related N-acetyltransferase  28.45 
 
 		 171 aa  43.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>