38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3171 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3171  citrate lyase ligase  100 
 
 		 357 aa  744    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.16085  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3007  citrate lyase ligase  69.65 
 
 		 352 aa  511  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.52417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00575  hypothetical protein  69.36 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00586  citrate lyase synthetase  69.36 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0532  citrate lyase synthetase  69.36 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0637  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  69.65 
 
 		 352 aa  511  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0669  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  69.65 
 
 		 352 aa  511  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.850231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3026  citrate lyase ligase  69.65 
 
 		 352 aa  511  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0706  citrate lyase synthetase  69.08 
 
 		 352 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0737  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  68.79 
 
 		 358 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0724  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  68.79 
 
 		 358 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0664  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  68.79 
 
 		 358 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0783  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  68.79 
 
 		 358 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.46183  normal  0.28967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0678  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  68.79 
 
 		 358 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2410  citrate lyase ligase  55.87 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0323  citrate (pro-3S)-lyase ligase  50.45 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0062  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  53.01 
 
 		 343 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.93415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0064  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  52.71 
 
 		 343 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  52.41 
 
 		 343 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.286677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0065  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  52.41 
 
 		 343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  52.41 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  0.752435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3375  citrate lyase ligase  47.34 
 
 		 341 aa  316  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2220  citrate lyase ligase  48.45 
 
 		 347 aa  311  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2322  citrate lyase ligase  48.31 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1752  citrate lyase ligase  47.06 
 
 		 354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2025  citrate lyase ligase  46.44 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1162  citrate lyase ligase  38.1 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.161985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04660  (Citrate (pro-3S)-lyase) ligase  33.14 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1673  citrate lyase ligase  36.3 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3862  citrate lyase ligase  36.99 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1088  citrate lyase ligase  36.68 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3947  citrate lyase ligase  36.36 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190715 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0420  citrate lyase synthetase  32.92 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1522  citrate lyase ligase  31.74 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0439  cytidyltransferase-related domain protein  43.92 
 
 		 688 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05301  citrate lyase ligase  37.91 
 
 		 262 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1751  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 155 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1709  Sulfate adenylyltransferase  41.3 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>