53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0420 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0420  citrate lyase synthetase  100 
 
 
348 aa  704    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3375  citrate lyase ligase  38.87 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3947  citrate lyase ligase  38.89 
 
 
333 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3862  citrate lyase ligase  37.96 
 
 
333 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1673  citrate lyase ligase  39.16 
 
 
347 aa  209  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2322  citrate lyase ligase  37.2 
 
 
347 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1522  citrate lyase ligase  38.48 
 
 
342 aa  207  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1162  citrate lyase ligase  37.29 
 
 
345 aa  205  9e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.161985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3007  citrate lyase ligase  35.26 
 
 
352 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.52417  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0532  citrate lyase synthetase  35.26 
 
 
352 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0637  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  35.26 
 
 
352 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3026  citrate lyase ligase  35.26 
 
 
352 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0669  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  35.26 
 
 
352 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.850231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00586  citrate lyase synthetase  34.95 
 
 
352 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00575  hypothetical protein  34.95 
 
 
352 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2220  citrate lyase ligase  36.53 
 
 
347 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0724  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  35.33 
 
 
358 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0664  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  35.33 
 
 
358 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0678  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  35.33 
 
 
358 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0737  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  35.33 
 
 
358 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0783  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  35.33 
 
 
358 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.46183  normal  0.28967 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0323  citrate (pro-3S)-lyase ligase  35.91 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0706  citrate lyase synthetase  34.76 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1752  citrate lyase ligase  37.12 
 
 
354 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2025  citrate lyase ligase  37.46 
 
 
354 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04660  (Citrate (pro-3S)-lyase) ligase  38.03 
 
 
359 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1088  citrate lyase ligase  37.42 
 
 
338 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0064  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  34.23 
 
 
343 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0062  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  36.54 
 
 
343 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.93415  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3171  citrate lyase ligase  32.92 
 
 
357 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.16085  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  36.21 
 
 
343 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0065  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  35.88 
 
 
343 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  35.88 
 
 
343 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  0.752435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2410  citrate lyase ligase  33.33 
 
 
364 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0439  cytidyltransferase-related domain protein  38.65 
 
 
688 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05301  citrate lyase ligase  32.74 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2069  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  39.39 
 
 
167 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3756  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.81 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4030  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.81 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0157676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1210  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.81 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561592  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3671  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.81 
 
 
163 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0440326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3976  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.81 
 
 
163 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4139  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.81 
 
 
163 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3841  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.81 
 
 
163 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3688  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.81 
 
 
163 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.756476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3943  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.81 
 
 
163 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4041  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.81 
 
 
163 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000581015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0163  phosphopantetheine adenylyltransferase  34.33 
 
 
159 aa  46.2  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2632  phosphopantetheine adenylyltransferase  37.31 
 
 
163 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000126896  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  37.31 
 
 
162 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00059  phosphopantetheine adenylyltransferase  35.82 
 
 
162 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10020  Phosphopantetheine adenylyltransferase  38.81 
 
 
159 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000130207  hitchhiker  0.000000322675 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05610  Phosphopantetheine adenylyltransferase  35.71 
 
 
176 aa  42.7  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  normal  0.709032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>