37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2410 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2410  citrate lyase ligase  100 
 
 		 364 aa  763    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3171  citrate lyase ligase  55.87 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.16085  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3007  citrate lyase ligase  53.1 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.52417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00586  citrate lyase synthetase  53.1 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0532  citrate lyase synthetase  54.18 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0637  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  53.1 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3026  citrate lyase ligase  53.1 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0669  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  53.1 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.850231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00575  hypothetical protein  53.1 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0706  citrate lyase synthetase  52.51 
 
 		 352 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2220  citrate lyase ligase  54.92 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2322  citrate lyase ligase  53.12 
 
 		 347 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0724  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  52.63 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0664  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  52.63 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0678  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  52.63 
 
 		 358 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0737  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  52.63 
 
 		 358 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0783  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  52.63 
 
 		 358 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.46183  normal  0.28967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3375  citrate lyase ligase  47.46 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2025  citrate lyase ligase  49.85 
 
 		 354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1752  citrate lyase ligase  49.54 
 
 		 354 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0323  citrate (pro-3S)-lyase ligase  47.85 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0062  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  48.26 
 
 		 343 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.93415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  48.26 
 
 		 343 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.286677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0065  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  47.95 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  47.95 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  0.752435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0064  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  48.26 
 
 		 343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1162  citrate lyase ligase  36.55 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.161985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04660  (Citrate (pro-3S)-lyase) ligase  33.93 
 
 		 359 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1088  citrate lyase ligase  36.66 
 
 		 338 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3947  citrate lyase ligase  36.57 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190715 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1673  citrate lyase ligase  36.16 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3862  citrate lyase ligase  35.6 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0420  citrate lyase synthetase  33.33 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1522  citrate lyase ligase  32.67 
 
 		 342 aa  162  9e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0439  cytidyltransferase-related domain protein  41.49 
 
 		 688 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05301  citrate lyase ligase  38.14 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  28.18 
 
 		 147 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>